2003年，作为中国科研体制改革“试验田”的北生所开始筹建，其目标是出人才、出成果、出机制。王晓东是北生所第一、二任所长，他对《中国新闻周刊》介绍，北生所目前每年能获得2.5亿元的稳定经费支持，分别来自北京市、科技部和清华大学。北生所实行理事会下的所长负责制，行政、财务完全自主。

duipingtaiqiyedezhichicongbu“yinyefeishi”，duijinrongkejichuangxindeguliyemeiyou“haizihezangshuiyiqidao”，zhexianglaishijinrongguanlibumendetaidu，yaoguifanyeyaocufazhan，gei“fadan”yegeizhengce。对(dui)平(ping)台(tai)企(qi)业(ye)的(de)支(zhi)持(chi)从(cong)不(bu)“(“)因(yin)噎(ye)废(fei)食(shi)”(”)，(，)对(dui)金(jin)融(rong)科(ke)技(ji)创(chuang)新(xin)的(de)鼓(gu)励(li)也(ye)没(mei)有(you)“(“)孩(hai)子(zi)和(he)脏(zang)水(shui)一(yi)起(qi)倒(dao)”(”)，(，)这(zhe)向(xiang)来(lai)是(shi)金(jin)融(rong)管(guan)理(li)部(bu)门(men)的(de)态(tai)度(du)，(，)要(yao)规(gui)范(fan)也(ye)要(yao)促(cu)发(fa)展(zhan)，(，)给(gei)“(“)罚(fa)单(dan)”(”)也(ye)给(gei)政(zheng)策(ce)。(。)