2003年，作为中国科研体制改革“试验田”的北生所开始筹建，其目标是出人才、出成果、出机制。王晓东是北生所第一、二任所长，他对《中国新闻周刊》介绍，北生所目前每年能获得2.5亿元的稳定经费支持，分别来自北京市、科技部和清华大学。北生所实行理事会下的所长负责制，行政、财务完全自主。

erzhongguoshizhongjiandingfengxingziweifangyudehezhanlve，shiweiyichengnuobushouxianshiyonghewuqi、buduiwuhewuqiguojiahewuhewuqiqushiyonghewuqidehewuqiguojia，shizhongjiangheliliangweichizaiguojiaanquanxuyaodezuidishuiping。而(er)中(zhong)国(guo)始(shi)终(zhong)坚(jian)定(ding)奉(feng)行(xing)自(zi)卫(wei)防(fang)御(yu)的(de)核(he)战(zhan)略(lve)，(，)是(shi)唯(wei)一(yi)承(cheng)诺(nuo)不(bu)首(shou)先(xian)使(shi)用(yong)核(he)武(wu)器(qi)、(、)不(bu)对(dui)无(wu)核(he)武(wu)器(qi)国(guo)家(jia)和(he)无(wu)核(he)武(wu)器(qi)区(qu)使(shi)用(yong)核(he)武(wu)器(qi)的(de)核(he)武(wu)器(qi)国(guo)家(jia)，(，)始(shi)终(zhong)将(jiang)核(he)力(li)量(liang)维(wei)持(chi)在(zai)国(guo)家(jia)安(an)全(quan)需(xu)要(yao)的(de)最(zui)低(di)水(shui)平(ping)。(。)